پس از اینکه خواهر کوچکتر هیناتا هیوگا ربوده می شود، ناروتو باید هر کاری که می تواند برای نجات او انجام دهد و با یک فرد شرور به نام تونری مبارزه کند و...

هنگامی که یک دشمن جدید در شهر ظاهر می شود و آرامش را از بین می برد، ساکنان شهر بدون هیچ ردی ناپدید می شوند و ایچیگو برای کمک به مردم وارد عمل می شود و...

داستان انیمه به صدها سال قبل باز می‌گردد. جایی که انسان‌ها بدست تایتان‌ها کشته می‌شدند اما عده اندکی از آن‌ها موفق شدند در شهری با دیوارهای بسیار بلند (حتی بلندتر از بزرگترین تایتان‌ها) پناه بگیرند و جان سالم بدر ببرند. صد سال به همین منوال می‌گذرد تا اینکه...